登録申請は、加工業者の組織する団体（生産者団体）が行うことができます。すなわち、個人や企業単独では申請することができません。
ただし、生産者団体であって、なお、
「正当な理由がないのに、構成員たる資格を有する者の加入を拒み、又はその加入につき現在の構成員が加入の際に付されたよりも困難な条件を付してはならない旨の定めがあるもの」
に限られます。
この規定は、地域団体商標の出願人に求められる要件と同じです。
ただし、地域団体商標では出願人に法人格が要求されているのに対して、地理的表示法では法人格のない生産者団体であっても代表者や管理者の定めがあれば申請することができます。
また、外国の団体も申請することができ、複数の生産者団体が共同して申請することも可能です。
さらには、生産者団体を構成員とする団体も申請することができます。
